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尊敬的老师，您好！
当前的大数据时代对生物医学领域产生了巨大的影响，成为生物医学领域的最新驱动力。各种生物医学数据库应运而生，使得数据分析及数据挖掘在生物医学领域的应用具有重要的意义。其中GEO（GeneExpression Omnibus）是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。目前GEO数据库中共包含了近11万个数据集，约290万个标本，是一个极其庞大的巨无霸型公共数据库。临床医生可以从该网站上免费下载与自己研究方向相似的数据来进行分析，并撰写论文。
癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据,从而为发现影响肿瘤起始、发展、分化、转移等生物学机制提供了海量数据基础。
本次培训旨在指导临床医生从数据库里免费下载与自己研究方向相似的数据来进行分析，并撰写论文。通过将数据挖掘方法、生物信息学和医学统计学进行融合，挖掘公共数据库并提取有价值的信息，能够为研究者更深入的进行研究提供帮助。
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课程特色
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1. 针对相关软件进行实操教学，掌握各类数据挖掘方法的实现；
2. 实操配合案例解析，完整解读各类数据挖掘方法的运用及结果分析；
3. 深入讲解重点生物医学数据库的使用方法，结合数据库的在线工具和R语言编程分析各种类型数据；
4. 详细讲解公共数据库数据挖掘的研究策略，结合讲者的相关发文经验分享数据挖掘文章撰写的基本套路。
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课程安排
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| 日期 |
授课题目 |
授课内容 |
9月21日
上午
（8:30-12:45） |
数据挖掘介绍 |
数据挖掘简介 |
| 数据的来源（可利用的数据、不同数据的异同点、不同数据的挖掘方法） |
| 临床研究中生信数据应用实例分析与研究思路 |
公共数据库在临床科研应用中的应用思路 |
| 生信技术在临床研究中的应用思路及文献实例解析 |
| R语言基础实操（上） |
数据分析处理 |
9月21日
下午
（14:00-18:15） |
R语言基础实操（下） |
常用图表的制作 |
| 公共数据库数据检索、下载与分析处理 |
TCGA数据库的功能介绍及实操 |
| GEO数据库的功能介绍及实操 |
| 其他相关数据库的功能介绍及实操 |
9月22日
上午
（8:30-12:45） |
生物医学组学数据挖掘 |
聚类分析（概念、常用聚类方法及R软件实现与可视化） |
| 分类分析（决策树与随机森林原理、构建及结果的可视化等） |
| 主成分分析（概念，应用及案例解析） |
| Logistic回归分析与生存分析（列线图及校准图绘制） |
| 基因R的CancerSubtypes软件包的肿瘤亚型分析 |
| 基于数据挖掘的疾病关键调节分子（上） |
基于数据挖掘寻找关键疾病调控分子 |
| 网络拓扑性质简介、分子网络数据库介绍 |
| 案例讲解：应用网络拓扑性质识别疾病关键调控分子 |
9月22日
下午
（14:00-16:30） |
基于数据挖掘的疾病关键调节分子的探索（下） |
构建网络及可视化（Cytoscape） |
| Cytoscape软件介绍、Cytoscape插件简介 |
| 临床样本检测验证、后续结果分析与论文组装 |
解读生物数据与临床数据的整合分析思路 |
| 基于GEO与TCGA公共数据库挖掘的SCI论文写作与发表 |
| 肿瘤基因表达与免疫浸润的最新研究热点 |
| 服务与答疑咨询 |
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授课讲师
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廖奇 副教授 宁波大学医学院
曾作为访问学者在哈佛大学丹娜法伯癌症研究中心进修
研究方向：非编码RNAs的生物信息学分析。
研究成果：以第一作者或通讯作者身份在国际著名SCI期刊《Nucleic Acids Res》 (IF=10.162)等发表多篇论文。2010年，首次提出基因芯片中可检测长非编码RNA表达谱的设想，利用GEO数据库中重注释的基因芯片数据，构建长非编码RNA与蛋白编码基因的双色共表达网络，对长非编码RNA的功能进行大规模的预测，该工作目前已被引用超过200次，为长非编码RNA的功能注释领域开创了新的方法。主持多项国家自然科学基金、省自然科学基金、市自然科学基金，参编教材4部。目前同时担任浙江省生物信息学学会副秘书长，浙江省预防医学会卫生统计学专业和寄生虫专业委员会委员。
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华琳 副教授 首都医科大学生物医学工程学院
研究方向：生物统计与生物信息学。
研究成果：主讲《医学统计学》、《医用数据挖掘》、《医药数理统计方法》、《临床及分子生物学大数据处理》和《生物信息学技术概论》等课程。擅长统计研究设计、各类型数据统计分析、生物医学大数据挖掘及生物信息学分析等，近5年内在相关领域以第一作者和通讯作者发表论文30余篇，其中SCI论文近20篇。主持和参与多项国家级、省部级和局级科研课题，与北京多家临床医院开展了数据分析方面的合作，并建立了良好的合作关系，目前是首都医科大学中青年骨干教师和北京市中青年骨干教师。
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举办单位
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医盟V课堂
南京采卓生物科技有限公司
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时间地点
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2019年9月21日-2019年9月22日
中国·南京
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参加对象
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从事医学、生命科学等相关专业的科研人员；
对生物医学数据挖掘及分析的具体方法有学习需求的医护人员、医学生、药企科研人员；
临床忙、没时间做实验或研究条件有限，希望将临床大数据应用与临床研究中并对SCI论文发表有迫切需求的医学生、临床医生及科研工作者。
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授课方式
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理论讲授和实际操作紧密结合。每位学员在辅导教师的指导下，独立完成实操。
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收费标准
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3199元/人，与医盟V1会员（线上课程365天观看权益）组合价格3899元/人，注册费含会场、专家讲课费、教材、其他费用。不含住宿费、交通差旅费！
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报名方式
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学员请填写“报名回执”通过电子邮件发至秘书处注册，会议纸质邀请函将由会议秘书在会议结束时统一发放，发票将在会后一周内以电子发票形式发送至报名邮箱。
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联系方式
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郑老师：18114021806
E-mail：ymvkt2017@163.com
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通知及回执下载：会议通知及报名回执表格，点击下载，请您查收！
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